甲紫和龙胆紫两者是同一物质，并没有什么区别。

甲紫，又名碱基青莲，碱性紫等。有机化合物。有机染料的一种，也可作药用。主要成分是氯化四甲基副玫瑰苯胺、氯化五甲基副玫瑰苯胺与氯化六甲基副玫瑰苯胺的混合物，为紫色的颗粒性粉末，有臭味，在乙醇中溶解，水中微溶。其溶液通常称紫药水(含甲紫1%)，为消毒防腐药，有较好的杀菌作用，对组织无刺激性，且能与粘膜、皮肤表面凝结成保护膜而起收敛作用。可用于表浅创面、溃疡及皮肤感染，如小面积烧伤、湿疹、疱疹、咽喉炎、鹅口疮等。龙胆紫，其1～2％溶液俗称紫药水，是人们所熟悉的外用药。

龙胆紫为一种碱性阳离子染料，因其阳离子能与细菌蛋白质的羧基结合，影响其代谢而产生抑菌作用。它能抑制革兰氏阳性菌，特别是葡萄球菌、白喉杆菌，对白色念珠菌也有较好的抗菌作用。它杀菌力强，对组织没有刺激性，也没有毒性和副作用。