α—酮戊二酸脱氢酶系的辅助因子有TPP、乙酰辅酶a、硫辛酸、FAD、NAD。

1.TPP：由维生素B1在体内转变而成，是重要的酮酸如α-酮戊二酸氧化脱羧酶系的辅酶；

2.乙酰辅酶a：是辅酶a的乙酰化形式，乙酰基与辅酶a的半胱氨酸残基的SH-基团相连。这其实是高能键硫酯键。它是脂肪酸的beta-氧化及糖酵解后产生的丙酮酸氧化脱羧的产物。在许多代谢过程中起着关键的作用;

3.硫辛酸：属于B族维生素中的一类化合物在多酶系统中起辅酶作用，催化丙酮酸氧化脱羧成乙酸及α-酮戊二酸氧化脱羧成琥珀酸的反应中转酰基作用；

4.FAD：全称黄素腺嘌呤二核苷酸，又称活性型维生素B2、核黄素-5-腺苷二磷酸，是糖代谢三羧酸循环中的一种重要黄素辅基，一些脱氢酶以它为辅基，维生素B2是它的活性基团；

5.NAD：是一种转递电子的辅酶，它出现在细胞很多新陈代谢反应中。NADH或NADHH是它的还原形式。