南京南站位于南京市雨花台区玉兰路98号，由于规模宏大。

必须说明整体架构。

南京南站的整个站房分为五个层面，

地下两层为地铁站和商业区，肯德基、星巴克、麦记等餐饮在地下一层地铁出站口外，在地铁口出来的大厅有自助取票机。

地面一层为换乘大厅(铁路出站口处)，86台出站检票系统。

地面二层为出发厅，站台层、有购物和些许纪念品店。

24个检票口

地面三层为候车厅，线上式出发层，候车层在站台层上方，无论旅客从南广场进站还是北广场进站，候车大厅南北畅通。

候车厅为全开放式的空间，不设立分割的候车室。

在这里，市民只要通过“安检”，无需买票即可进入购物或是到落客平台上观光。

候车厅有面包新语、哈根达斯、永和类的小点店面。

有寄存处、免费供水点。

各层通过130部电梯上下连通，198台进出站检票系统。

南京南站以自助售取票为主，人工售票为辅。

地上三层均设有售票区，共配备自助售票机60台。

在地面到达层北面出口、有改签退票窗口。

地面二层售票厅有自助取票和人工取票、地面三层售票厅，只有售票取票。

地面西侧的南广场售票大厅设置10台自助售取票机，4个人工窗口，售票厅开放时间：5：30-22：30。

北广场进站候车的流线是：

旅客乘坐地铁3号出口和公交可以直接到达一层，然后凭票进站通过实名制验证和安检，通过地面一层换乘大厅的自动扶梯进入三层候车区。

或者通过东、西两侧的进站通道乘扶梯上二层，经过实名制验证和安检，再通过八部扶梯进入三层出发层。

而乘坐私家车、出租车、搭乘机场线来南站的旅客可以从二层的站台层的北落客平台进站乘坐扶梯才能到达出发层乘车。

南广场进站候车的流线是：

乘坐3号地铁线，公交的旅客可以通过地面到达层通道乘手扶梯直接到达第三层的候车层。

从地下层地铁1号地铁线出了地铁出站闸机，上4-6号出口电扶梯到地面到达层，换乘两部电扶梯，到南京南站三层候车大厅。

从江宁到南京南站东入口直接到三层南广场的14条匝道落客平台。

通过2个进站口（4个实名制验证和安检口）进入三层候车室。