北京的医科大学有：北京大学医学部、中国协和医科大学、首都医科大学等。

1.北京大学医学部：北京大学医学部的前身是国立北京医学专门学校，创建于1912年10月26日，是中国政府教育部依靠中国自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立学校。2000年4月3日，原北京医科大学与北京大学正式合并，组建新的北京大学。

2.中国协和医科大学：中国协和医科大学的前身是“北京协和医学院”，由美国洛克菲勒基金会于1917年创办，它最早开启了我国八年制临床医学教育和高等护理学教育的先河，在我国医学教育领域具有特殊的地位和独特的社会影响力。

3.首都医科大学：首都医科大学建校于1960年，是北京市重点高等院校，“卓越医生教育培养计划”试点高校，著名泌尿外科专家、两院院士，全国人大常委会原副委员长吴阶平教授为首任校长和终身名誉校长。