分为三个阶段，各阶段特征为：1.发热升温阶段：堆肥初期，好氧性中温细菌和真菌利用污泥中最易分解的可溶解性物质迅速增殖，释放出热量，使堆体温度不断提高。2.高温消毒阶段：堆体热量的积累，温度逐渐上升到50摄氏度以上，好热性微生物逐渐代替中温微生物的活动，继续分解氧化堆体中残留的有机物以及一些复杂的有机物，病原菌、寄生虫卵与病被杀灭。3.降温和腐熟保肥阶段：微生物活动量减弱，产热量也随之减少，温度逐渐下降，中温微生物逐渐成为优势菌种，残余物质进一步分解，腐殖质继续不断地积累，堆肥进入腐熟阶段。