森林大面积减少会造成生物多样性的减少甚至灭绝。 生物多样性是指生物中的多样化和变异性以及物种生境的生态复杂性，它包括植物动物和微生物的所有种及其组成的群落和生态系统。

森林的大面积破坏在一定程度上已经可能直接导致该范围内的物种减少，而且物种由于生境的恶化，资源缺乏，导致竞争加剧，甚至改变原有的竞争关系。

物种灭绝的加剧，遗传多样性的减少，以及生态系统特别是热带森林的大规模破坏，引起了国际社会对生物多样性问题的极大关注。生物多样性丧失的直接原因主要有生境丧失和片段化、外来种的侵入、生物资源的过渡开发、环境污染、全球气候变化和工业化的农业及林业等。但这些还不是问题的根本所在。根源在于人口的剧增和自然资源消耗的高速度、不断狭窄的农业、经济系统和政策未能评估环境及其资源的价值、生物资源利用和保护产生的惠益分配的不均衡、知识及其应用的不充分以及法律和制度的不合理。