1.如果会计把发票账拿走了又做费发票重新开可以

这个问题说的很含糊，首先一点 你方作废发票 但是发票联和抵扣联都已经给购货方了 你方存在联次不全作废，属于一种未按规定开具发票行为，税务机关可以对你进行处罚；对于购物方，存在作废发票抵扣问题，税务机关也可以进行处罚，对于现在你们这种情况 税务机关官方的处理方式是，购货方进行进项税额转出，然后给销货方（也就是你们）的税务机关发协查函，销货方税务机关接受到协查函后，会对你家开具的发票进行认定 ，既是否缴税了，如已经缴税，则购货方可以抵扣，如未缴税，购货方不予抵扣税款。

补充一下，作为税务机关的人员可以明确的告诉你，无论对方是否不讲理，他那张发票也是没用的，如果你方主动去税务机关申请说明情况，发协查函应该不用对你方进行处罚。