共十三个线路，具体站点如下：

1.S1线路途径站点：金沙洲码头、黄沙码头。

2.S2线路途径站点：芳村码头、黄沙码头、西堤码头、天字码头、大元帅府码头、中大码头、广州塔码头。

3.S3线路途径站点：如意坊码头、坦尾码头。

4.S4线路途径站点：海幢码头、西堤码头、鳌洲码头。

5.S5线路途径站点：鱼珠码头、黄埔军校码头、新洲码头、深井码头。

6.S6线路途径站点：第一段：黄沙码头、芳村码头；第二段：芳村码头、永兴街码头。

7.S7线路途径站点：天字码头、纺织码头。

8.S8线路途径站点：省总码头、堑口码头。

9.S9线路途径站点：白蚬壳码头-白鹤洞码头。

10.S10线路途径站点：鱼珠码头、长洲码头。

11.S11线路途径站点：广州塔码头、海心沙码头。

12.S12线路途径站点：长洲码头、鱼珠码头、海心沙码头。

13.S13线路途径站点：南浦锦绣半岛码头、白蚬壳码头、黄沙码头。