1.滇池:滇池曾被誉为高原明珠，是中国西南地区最大的湖泊。湖泊面积300平方公里，流域面积2920平方公里，平均水深4.4米，最深处为10米，蓄水量为12.9亿立方米。平均水资源量5.7亿立方米，属水资源缺少地区，且年际变化大，存在连续丰水、连续枯水长周期变化的特点；

2.大理洱海:洱海是云南省第二大高原湖泊，湖泊面积250平方公里，流域面积2565平方公里，平均水深20.5米，蓄水量28.8亿立方米，多年平均水资源量8.25亿立方米，大小入湖河流117条。洱海流域主要包括大理市和洱源县18个乡镇；

3.玉溪澄江抚仙湖:抚仙湖是我国第二深水湖泊，是我省蓄水量最大的湖泊。湖泊面积212平方公里，流域面积674.69平方公里，最大水深157.3米，平均水深87.0米，蓄水量189.3亿立方米，其中大的河道有27条，湖水经海口河流入南盘江。