1.制造的原料不同。

蚝油：蚝油是以牡蛎为原料，经煮熟取汁浓缩，加辅料精制而成。蚝油味道鲜美、蚝香浓郁，黏稠适度，营养价值高，亦是配制蚝油鲜菇牛肉、蚝油青菜、蚝油粉面等传统粤菜的主要配料。

酱油：酱油分为酿造酱油和配制酱油。所谓酿造酱油、所谓配制酱油,其不同名称有不同的含义。酿造酱油是指以大豆或脱脂大豆、小麦或麸皮为原料，经微生物发酵制成的具有特殊色、香、味的液体调味品。而配制酱油是指以酿造酱油为主体，与酸水解植物蛋白调味液、食品添加剂等配制而成的液体调味品。“酿造酱油”不存在氯丙醇问题，只有“配制酱油”中才可能含有氯丙醇。

2.地区的用法不同。

北方人多用酱油，而南方沿海人多用蚝油，以至于不少北方人来到南方后以为这里同一种东西的两种称谓，其实不然。简单的讲，二者的制作原料不同。