化肥种菜和化肥种的粮食作物一样无毒。和农家肥相比较，化肥成分相对单纯，所含各种微量元素相对较少，因此瓜果产量虽然会很高，但味道要差一些。

不标准的化肥能让植物快速的生长，这就无形中让根更粗壮，加大了植物本身的能量输送，这样就把土壤中的重金属渗透到植物的输送通道里，从而造成重金属超标。

农作物在生长过程中所吸收的氮元素，是由含有硝酸根离子的化学肥料“供给、辅佐”的。生活中，若粮食作物、蔬菜中的硝酸盐含量超过规定健康阈值时，对人体健康危害是比较大的。在体内若硝酸盐含量过高，则易转化为亚硝酸盐，继而再产生致癌、致畸都比较强的亚硝胺。