南京大学与中国科技大学的排名相差无几，可以根据自己所选专业进行选择。

南京大学目前拥有专业硕士学位授权点24个，专业博士学位授权点1个，硕士学位授权一级学科18个，硕士学位授权二级学科点9个，博士学位授权一级学科40个，博士学位授权二级学科点3个，博士后流动站38个，国家级人才培养基地13个；有一级学科国家重点学科8个，二级学科国家重点学科13个，江苏高校优势学科建设工程二期项目立项学科与重点序列学科22个。

中国科技大学目前有34个一级学科硕士学位授权点，同时还拥有MBA、EMBA、MPA、法律硕士、金融、应用统计、翻译、新闻与传播、文物与博物馆、工程管理、工程硕士等专业学位授权点，21个博士后流动站；学校有8个一级学科国家重点学科、4个独立的二级学科国家重点学科、2个国家重点学科、19个安徽省一级重点学科。一级学科国家重点学科数列全国高校第6。